药物设计学考研可以选择以下几所优秀的学校：

中国科学院大学

招生人数：1人。

院系：上海药物研究所。

特点：中国科学院大学药物设计学专业排名靠前，专业热门，竞争激烈，考研难度较大。学校覆盖31个省，900多所院校，443282个专业，具有很高的权威性。

北京大学

城市名：北京市。

学校属性：双一流。

特点：北京大学的药物设计学专业也非常强大，但具体的招生人数、专业排名和考研难度等信息需要进一步查询。

华东理工大学

特点：在药物化学领域全球排名第三，药物设计方面的研究院较强。

中国药科大学 和 沈阳药科大学

特点：这两所大学在药学专业方面非常强，尤其是药物设计方向。

中国科学院上海药物研究所

特点：该研究所在药物设计学领域的研究方向非常重要，主要培养学生的科研能力。

中国科学院昆明植物研究所 和 中国科学院成都生物研究所

特点：这两家研究所在植物化学、药化和药理等领域有较强的研究实力，但具体的药物设计学方向和考研信息需要进一步查询。

建议

中国科学院大学：由于其在药物设计学领域的强大实力和较高排名，建议优先考虑，但需注意其考研竞争激烈。

北京大学：作为双一流高校，其药物设计学专业也非常值得考虑，但需进一步了解其具体的招生和录取情况。

华东理工大学、 中国药科大学和 沈阳药科大学：在药物设计学领域也有较强的实力，尤其是华东理工大学在药物化学领域的全球排名较高，可以作为备选。

中国科学院上海药物研究所：如果对科研能力有较高要求，也是一个很好的选择。

根据以上信息，考生可以根据自己的实际情况和目标，选择最适合自己的学校进行报考。