根据近年考研数据，清华大学部分专业存在招生名额不足的情况，以下为综合多个来源整理的冷门且招不满的专业推荐：

一、数学科学系

应用统计（专硕）：该方向近年报考热度较高，但名额相对较少，需注意调剂机会。

二、化学系

化学专业：基础学科招生名额有限，竞争压力较大。

化学生物学（制药方向）：属于交叉学科，招生规模较小。

三、微纳电子系

集成电路工程（专硕）：随着科技发展，该方向需求持续增长，但研究生数量有限。

四、地球系统科学研究中心（地学中心）

大气科学专业：属于基础学科，近年招生名额缩减，需关注校内调剂。

五、精密仪器系（深研院）

仪器仪表工程（专硕）：工科领域冷门方向，常需通过调剂录取。

六、软件学院

软件工程（专硕）：热门专业但竞争激烈，调剂需求较大。

七、医学院

生物医学工程（含专硕）：跨学科专业，招生名额有限。

八、航天航空学院

生物力学、固体力学：航空航天领域特色方向，但招生规模较小。

九、其他冷门专业

国际关系学院公共管理硕士（校内调剂）：接收调剂名额较少。

建筑与景观设计学院风景园林非全日制：非全方向存在上线不足现象。

信息科学技术学院量子电子学、电磁场与微波技术：专业方向缺额较大。

建议：

关注校内调剂：

部分专业（如微纳电子、材料科学等）常通过校内调剂弥补名额不足，可优先关注。

结合自身兴趣与职业规划：

冷门专业可能对应特定领域，需评估与个人发展的契合度。

参考最新招生简章：

招生名额可能因年份、学科发展调整，需以官方信息为准。

以上信息综合自多个来源，供参考决策。