根据权威性搜索结果显示，考研数学教师杨超的本科毕业于 中国科学技术大学数学系。以下是相关信息的综合说明：

教育背景

本科阶段：

杨超于1998年毕业于中国科学技术大学数学系，获得数学专业学士学位。

后续发展：2001年进入山东师范大学教育科学学院攻读教育学原理专业硕士研究生，2002年赴韩国檀国大学交流学习，2004年完成中山大学马克思主义理论与思想政治教育专业博士学位。

学术与职业经历

杨超目前担任中山大学数学与计算科学学院讲师，主持多项国家级课题，并在图论、组合数学等领域取得显著成果。

除学术研究外，他还活跃于教育领域，出版多本考研辅导书籍，如《考研数学必做986题》等。

综上，杨超的本科院校是中国科学技术大学，数学系是其学术生涯的起点。