根据搜索结果，本科南航考研的学校选择可参考以下建议：

一、优先选择本校

南京航空航天大学

- 作为南航本校，考研竞争压力较小，且航空航天领域资源丰富，推荐报考本校相关专业（如飞行器设计与制造、能源与动力工程等）。

- 对于希望继续深造航空领域的考生，本校转系难度较低。

二、重点推荐其他985/211高校

北京航空航天大学

- 工业和信息化部直属，飞行器科学与技术、材料科学与工程等专业实力顶尖，是航空航天领域考研的首选院校。

南京大学

- 国家“双一流”建设高校，数学、物理、材料科学等学科优势显著，适合跨学科考生。

复旦大学

- 教育部直属，综合实力强，尤其在机械工程、电气工程等领域有突出表现，适合多领域发展。

三、其他选择建议

跨专业考生：

若需转系，本校难度较低；若原专业有对应高校（如北航的航空系），也可考虑报考。

区域偏好：北京航空航天大学和南京大学位于北京和南京，复旦大学在长三角地区，可根据地理位置和职业规划选择。

四、注意事项

专业匹配：

优先选择与本科专业相关的院校，或认可度高的综合性大学。

校区选择：

明故宫校区（航空宇航等专业）和江宁校区（后六院起）是考研集中地，可根据目标院校分布选择。

建议结合自身分数、专业方向及职业规划，综合评估后制定备考方案。